水箱在正常工况下是起散热作用的，但是一旦水箱四周产生水垢，就会大大影响水箱的散热作用。因为水垢的导热系数很低，仅是铸铁的1/25，黄铜的1/50，形成于缸体衬里及缸盖水道的水垢，使局部区域因散热性变差而温度上升，会导致发动机薄弱部位产生裂纹及缸盖变形。

a.普通水垢清洗剂：需拆卸水箱，清除不彻底、异味大、腐蚀性强，易造成水箱老化，缩短其使用寿命。
b.人工清理法：需把汽车水箱拆卸下来，用人工锤、刮、铲等清除水垢；除垢效率低、劳动强度大，不易清除干净，易造成水箱二次损害。
c.专业汽车水箱除垢剂：不需拆卸即可清洗，还可在不停车的条件下清洗。可直接将专用的水垢清洗剂倒入汽车水循环系统中，让其浸泡、怠速循环或行驶20-30分钟后，将水箱及系统内部的除垢剂排放掉，加水反复冲洗干净既可有效清除发动机水循环系统中的水垢、锈、泥及各种有害物质。